Durante el crecimiento celular, el pH del medio puede cambiar debido a los metabolitos liberados por las células o durante la contaminación bacteriana. La presencia de rojo de fenol, como indicador de pH en el medio de cultivo, permite monitorear estas variaciones de pH. A niveles de pH ácidos, el rojo de fenol se vuelve amarillo, mientras que a niveles de pH básicos, es más bien de un rosa oscuro. Para la mayoría de los trabajos de cultivo celular (a pH 7,4), el medio debería ser rojo.

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